激しい戦いを終えた虎杖悠仁、伏黒恵、釘崎野薔薇は、それぞれの心に深い爪痕を残していた。悠仁は、呪霊がかつて人間だったという現実に苦しみながらも、「それでも人を守る」と自らの信念を再確認する。伏黒は仲間の成長を感じつつも、自分の力不足を痛感し、さらなる強さを求める決意を固める。釘崎は一見いつも通りの強気な態度を見せながらも、心の奥では命の重みと恐怖を噛みしめていた。一方その頃、呪霊側では真人が再び動き出し、人間社会に新たな混乱をもたらす計画を進めていた――静けさの中に潜む不穏な気配が、次なる戦いの幕開けを予感させていた。
少年院に潜入した虎杖悠仁、伏黒恵、釘崎野薔薇の3人は、想像を超えるほどの強力な特級呪霊と遭遇する。圧倒的な呪力の前に野薔薇が分断され、伏黒と悠仁は必死に連携しながらも追い詰められていく。戦いの最中、悠仁は自らの命を顧みずに仲間を逃がそうと決意し、宿儺の力を解放する覚悟を固める。その瞳には恐怖ではなく、誰かを守りたいという強い意志が宿っていた。だが、その行動が、彼自身の運命をさらに大きく狂わせていくことになる――。
呪術高専への入学を決めた虎杖悠仁は、五条悟に連れられて東京の呪術高専を訪れる。そこで彼は、すでに在学している2年生の伏黒恵と、1年生の釘崎野薔薇に出会う。最初の任務として、悠仁と野薔薇は五条の指示で廃ビルに潜む呪霊の討伐へ向かうことになる。緊張と恐怖の中、悠仁は初めて本格的に呪いと対峙し、人を守るために戦う覚悟を新たにするのだった。
七海建人は渋谷の地下で大量の呪霊を相手に圧倒的な実力を見せつけ、冷静沈着にひとつずつ確実に殲滅していく。その中で彼は、かつての仲間や過去の記憶を思い返しながら、「この混乱を終わらせる」という強い意志を固める。一方、虎杖のもとへ向かう七海の表情には、これから訪れる激闘を覚悟する静かな決意が宿っていた。
虎杖悠仁、伏黒恵、釘崎野薔薇は、強大な呪霊との戦いの中で、連携の精度をさらに高める。悠仁は恐怖を抑えつつ、宿儺の力に頼らず自分の呪力で攻撃を重ねる決意を固める。伏黒は巧妙な呪力操作で敵の動きを封じ、釘崎は正確な打撃で弱点を突く。三人の連携は次第に一つの流れとなり、呪霊に致命的なダメージを与えることに成功する。しかし、その戦いの最中で、敵が持つ異常な再生能力や策略により、悠仁たちはさらなる危機に直面する。勝利は目前に見えるものの、戦いの緊張は一瞬も緩まない――。
第259話では、宿儺（すくな）が「神の炎（Divine Flame）」を解放し、強力な熱と爆風で戦場を焼き尽くす。 チョソウはユウジを守るために血のバリアを張り、自らを犠牲にして致命的なダメージを受ける。 ユウジとチョソウは魂の世界で最後の言葉を交わし、兄弟としての絆を再確認。突如、東堂（トドウ） が戦場に現れ、包囲を解かれたユウジとともに宿儺に立ち向かう構えを見せる。
虎杖悠仁、伏黒恵、釘崎野薔薇は、連続失踪事件の調査を進めるうちに、被害者たちが同じ建物周辺で消息を絶っていることを突き止める。現場を調べる三人は、建物全体に満ちる異様な呪力を感じ取り、そこが呪霊によって歪められた空間であることに気づく。やがて、闇の中から姿を現したのは、人間の形を保ちながらも呪いに蝕まれた異形の存在――その姿に悠仁は強い衝撃を受ける。戦闘が始まり、三人は連携して立ち向かうが、敵は人間の感情を利用して攻撃してくる厄介な術式を持っていた。戦いの中で悠仁は、“呪いは人の心から生まれる”という現実を改めて思い知らされるのだった――。