五条悟が封印され、渋谷は完全に呪霊たちの支配下に落ちた。虎杖悠仁、伏黒恵、釘崎野薔薇はそれぞれ散開し、一般人の救出と情報収集に奔走する。だが街は結界によって歪められ、呪霊が次々と人間を襲う地獄と化していた。虎杖は罪悪感と怒りを胸に、宿儺の存在を抑えながら戦場へと飛び込む。一方、伏黒は冷静に指揮を取り、釘崎は単独で呪霊を追跡しながら仲間のために奮闘する。彼らの前に立ちはだかるのは、五条封印の報を聞いて勢いづいた強力な呪詛師たち――“人の悪意”そのものが渋谷を覆っていた。それでも悠仁は拳を握りしめ、仲間と共に戦うことを選ぶ。「五条先生を取り戻す。そのために、何度でも立ち上がる」――闇の中で、虎杖の瞳だけが確かに光を宿していた。
第209話では、米軍をはじめとする外国の軍隊が夜中にコロニー（結界）に侵入し、呪術師たちを拘束し始める。羂索（ケンジャク）はこれを自分の計画の一部として語り、非術師が死ぬことで大量の呪力を得る目的を明かす。虎杖（ユウジ）、伏黒（メグミ）、ハナらは軍と対峙し、彼らの真意を問いただそうとする。
虎杖悠仁、伏黒恵、釘崎野薔薇は、新たな呪霊事件の現場で予想外の強敵に直面する。その呪霊は、以前の戦いとは異なり、理性を持ったかのような戦略的な動きで三人を翻弄する。悠仁は恐怖を感じながらも、仲間と息を合わせ、攻撃のタイミングを計る。伏黒は呪力を駆使してサポートし、釘崎は正確な打撃で隙を突く。三人の連携が少しずつ形を成す中、悠仁は自分が単独で戦うのではなく、仲間と共に立ち向かうことの強さを痛感する――だが、背後ではさらに大きな陰謀の気配が静かに動き始めていた。
虎杖、伏黒、野薔薇は市街で呪詛師による一般人への嫌がらせを捜査し、巧妙な術式の範囲を突き止めて討伐。捕まえた呪詛師はキャバ嬢の客で、恨みによって呪いを使っていた。虎杖は五条との最後の対話を思い返し、彼の遺志を引き継ぐ決意を新たにする。最後に、両面宿儺の“最後の指”が未封印のまま残っていることが明かされ、新たな可能性が示される
第241話では、高羽（タカバ）の過去が大学時代のコメディアン時代を通じて描かれ、彼がなぜ笑いを大切にしてきたかが明らかになる。タカバはケンジャクに向かって心から土下座し、自分の弱さや孤独を告白する。彼は「みんなを笑わせたい」という決意を新たにし、呪術技も復活してケンジャクとの決戦に再び挑む覚悟を示す
ついに東京校と京都校の交流会が開幕する。会場には五条悟をはじめとする教師陣、そして両校の生徒たちが集まり、緊張感と熱気に包まれていた。だが、その裏では京都校の学長・楽巌寺嘉伸が、虎杖悠仁の抹殺を密かに指示していた。久々に姿を現した悠仁に驚く京都校メンバーの中で、東堂葵だけは彼に強い興味を示し、開幕早々、圧倒的な力で挑みかかる。悠仁は全力で応戦するが、東堂の怪力と戦闘センスは桁外れだった。戦いの中で、東堂は悠仁の「理想の女性像」を聞き出し、意外な共感を覚える――この出会いが、二人の関係に思いもよらぬ絆を生み始めるのだった。
伏黒は重面春太との死闘の中で限界を超えて追い詰められるが、仲間を守るためにさらに攻勢に転じる決意を固める。一方、虎杖は渋谷の混乱をかき分けながら呪霊たちを次々と倒し、より深い階層へと進んでいく。それぞれが孤独な戦場で命を懸けて戦い続け、渋谷事変はさらに凄惨な局面へ突入していく――。