静かな日常が戻ったかに見えた呪術高専。しかしその裏で、真人とその仲間・夏油傑の暗躍が着々と進んでいた。彼らは人間社会に紛れ、呪霊と人間の境界を壊す新たな計画を実行しようとしていた。一方、虎杖悠仁たちは五条悟から新たな任務を受け、街中で発生している奇妙な呪力反応の調査へと向かう。現場では、人間が突如として呪い化するという異常な現象が発生しており、悠仁は目の前で人が変わり果てていく光景に言葉を失う。伏黒と釘崎は冷静に状況を分析しつつ、悠仁を支えるが、三人の前に立ちはだかるのは、まるで真人の手口を模倣したかのような新たな呪霊だった――。暗雲が立ち込める中、再び“人と呪い”の境界が揺らぎ始めていく。
虎杖は呪力を奪われたまま日車と激しく殴り合う。日車は虎杖の覚悟と誠実さに揺らぎ始め、戦いの空気が少しずつ変わっていく。虎杖の必死の抵抗が日車の心に影響を与える回。
渋谷事変からの余波として、東京はほぼ呪霊によって占拠され、23区の大部分が壊滅的な被害を受ける。乙骨憂太（ユタ）が帰国し、呪術高専に復帰。五条や渋谷事件に関する高専内部の決定事項が明かされ、悠仁・虎杖の死刑執行が再び議題に上る。
激しい戦いを終えた虎杖悠仁、伏黒恵、釘崎野薔薇は、それぞれの心に深い爪痕を残していた。悠仁は、呪霊がかつて人間だったという現実に苦しみながらも、「それでも人を守る」と自らの信念を再確認する。伏黒は仲間の成長を感じつつも、自分の力不足を痛感し、さらなる強さを求める決意を固める。釘崎は一見いつも通りの強気な態度を見せながらも、心の奥では命の重みと恐怖を噛みしめていた。一方その頃、呪霊側では真人が再び動き出し、人間社会に新たな混乱をもたらす計画を進めていた――静けさの中に潜む不穏な気配が、次なる戦いの幕開けを予感させていた。
伏黒がレジィとの激闘に勝利し、戦いが決着する。レジィは伏黒の強さを認めながら倒れ、伏黒は大きな代償を払いながら次の行動へ進む。結界内の状況がさらに変化していく回。
虎杖と東堂の連携によって、真人は完全に追い詰められ、これまでの余裕を失い焦りを見せる。虎杖は七海や仲間たちの思いを胸に、怒りと覚悟を力に変え、決定的な一撃を繰り出す。真人も形態変化と術式で最後の抵抗を試みるが、渋谷の戦場での戦いはついに決定的な局面へ突入し、勝敗の行方が大きく揺れ動こうとしていた――。
廃ビルでの初任務中、虎杖悠仁と釘崎野薔薇は想像以上に強力な呪霊と遭遇する。野薔薇が人質を取られ、窮地に陥ったその瞬間、悠仁は自らの危険を顧みずに彼女を救い出そうとする。激しい戦闘の末、悠仁は宿儺の力を一時的に借りて呪霊を撃破するが、その代償として再び宿儺に体を奪われてしまう。伏黒は急いで現場に駆けつけ、暴走した宿儺に立ち向かう決意を固める――物語はいよいよ、呪いと人間の境界が崩れ始める緊迫の展開へと進んでいく。