五条悟が戦場に姿を現した瞬間、空気が変わった。周囲の呪霊たちはその“存在”だけで怯え、花御でさえ一歩退く。悠仁と東堂が限界まで戦ってきた激戦の跡を見て、五条は微笑みながらも、その瞳には冷徹な光を宿していた。花御は全力で攻撃を仕掛けるが、五条の「無下限呪術」はすべてを無に帰す。彼の一挙手一投足が空間そのものを支配し、花御の攻撃は一切届かない。五条はそのまま術式を展開し、圧倒的な呪力の奔流で花御を吹き飛ばす。その光景に悠仁は“本物の呪術師”の力を目の当たりにし、ただ言葉を失う。花御は満身創痍のまま撤退し、呪霊側の襲撃は失敗に終わる。しかし五条はその背中を見送りながら、「これはほんの序章にすぎない」と感じ取っていた――闇の戦いは、まだ始まったばかりだった。
宿儺との契約によって命を取り戻した虎杖悠仁は、呪術高専の医務室で静かに目を覚ます。自分が再び生きていることに戸惑いながらも、宿儺の中で交わした不気味な契約の記憶が脳裏を離れない。一方、伏黒と釘崎は悠仁の死を知らされ、深い悲しみの中でそれぞれの想いを抱えていた。そんな中、五条悟は悠仁の存在をしばらく秘密にしておくことを決め、彼に特別な訓練を課す準備を始める。悠仁は自らの無力さを痛感しながらも、「もっと強くなって人を救いたい」と新たな決意を胸に刻むのだった。
第248話では、日暮丸の命をかけた計画が失敗し、彼は命を落とす. ユウジは反転術式を習得し、自分の傷を回復させて戦闘を継続する。その直後、**乙骨優太（ユタ）**が戦場に登場し、宿儺との対峙が始まる。
七海建人は渋谷の地下で大量の呪霊を相手に圧倒的な実力を見せつけ、冷静沈着にひとつずつ確実に殲滅していく。その中で彼は、かつての仲間や過去の記憶を思い返しながら、「この混乱を終わらせる」という強い意志を固める。一方、虎杖のもとへ向かう七海の表情には、これから訪れる激闘を覚悟する静かな決意が宿っていた。
虎杖と東堂の連携攻撃により、真人は完全に追い詰められ、冷酷さを失い焦りを見せる。虎杖は七海や仲間たちの思いを胸に、怒りと覚悟を力に変えて最後の反撃に挑む。真人も形態変化と術式を駆使して抵抗を試みるが、渋谷の戦場では、三者の戦いがついに決定的な局面へ突入し、勝敗の行方が大きく揺れ動こうとしていた――。
渋谷での戦いからしばらく経ち、虎杖悠仁たちはそれぞれの成長を見せながら、京都校との交流会に向けて準備を進めていた。伏黒恵と釘崎野薔薇は実戦訓練で互いを高め合い、悠仁も七海との修行で得た経験を糧に呪力の扱いをさらに磨いていく。一方、京都校では東堂葵や加茂憲紀、三輪霞など個性豊かなメンバーが登場し、東京校との対抗戦に向けて士気を高めていた。しかしその裏では、呪霊側が交流会を狙って不穏な動きを見せており、平穏な空気の中に確実に忍び寄る“闇”の影があった――。
虎杖悠仁と真人の因縁の戦いが再び激化する。真人は「多重魂（ソウルマルティプリシティ）」という術式を使い、複数の魂を融合させた改造人間を次々と放つ。虎杖は悲しみと怒りを胸に七海の言葉を思い出しつつ、冷静さを取り戻して戦闘スタイルを切り替え、「呪術師」としての決意を新たにする。